实验室本着“前一百、五大洲、多样性、可持续”的国际合作交流理念，持续提升实验室的国际化程度，取得了一系列重要进展。持续深化与香港中文大学、韩国釜山大学、美国匹兹堡大学、罗格斯大学等国际伙伴大学的合作与交流；全面发展与美国哥伦比亚大学、俄罗斯莫斯科国立罗蒙诺索夫大学、英国爱丁堡大学、加拿大多伦多大学、新加坡南洋理工大学等世界顶级名校的交流；重点强化与韩国首尔大学、蒙古国国立大学、印度普纳大学、斯里兰卡科伦坡大学等亚洲国际科研伙伴的项目合作，形成了“多层次、全方位”的国际化格局。

实验室积极鼓励并资助师生开展各种形式的国际学术交流，不断提高师生国际对话能力。牵头实施的国际区域性合作项目——“全球健康史计划（亚洲模块）”，填补了亚洲地区人类健康史研究的空白，取得了该领域在亚洲的核心话语权。实验室与俄罗斯莫斯科国立大学人类学研究所共建了中俄两国第一个考古领域高水平国际联合实验室，促进了“一带一路”国家文明交流互鉴，构建了中俄多元互动人文交流大格局。