法医考古学（Forensic Archaeology）是考古学原理、方法技术在法医环境下的应用，具体工作内容包括地面勘探、发掘记录、分析鉴定等，涉及考古学、法医科学、生物人类学、统计学等多学科内容。其应用范畴主要是犯罪现场和死亡调查，包括古代遗迹、近现代人权灾难、战争遗迹和当今刑事案件。

实验室近年来积极开展法医考古学的研究工作，对我国日本侵华时期多处“万人坑”遗址的遇难者遗骸开展了系统的国际化、标准化法医考古学调查，建立了一套完整的国际化信息数据库，对于推动“万人坑”这类具有重要历史价值和意义的证据类遗骸资源的规范化、程序化、标准化、国际化保护与研究具有重要的理论指导意义。此外，实验室积极参与组建国家烈士遗骸搜寻队，为国家英雄烈士遗骸搜寻鉴定工作提供了强有力的技术支撑和服务保障。